杭州师范大学医学院在原杭州医学高等专科学校（前身是浙江医科大学杭州分校）的基础上建立的。学院已拥有专业实验中心8个（机能实验室、形态实验室、公共基础实验室、综合实验室、手术实验室、科研实验室、卫生信息管理实验室、市场营销模拟实验室），多媒体教室15个，多媒体实验室13个，语音室4个，人体标本陈列室3个。图书馆总建筑面积2180平方米，总藏书量16.8万册，期刊、报纸500余种，并设有电子阅览室，中、外文献光盘数据库。学院设有信息网络中心。
杭州师范大学医学院现有临床医学（包括麻醉学、心电学、医疗美容、社区医学）、公共事业管理（卫生事业管理：下设医疗保险、卫生法学、卫生信息技术与管理、医药贸易等方面）、护理学等3个本科专业；临床医学、妇产科学、儿科学、麻醉学、心电学、护理学、市场营销（医药、器械营销）、药学、口腔医学等9个专科专业，其中护理学专业列入国家教育部教学改革示范专业，市场营销（医药、器械营销）列为浙江省高职高专重点专业，临床医学为校重点建设专业。
目前学院有全日制在校学生2935人，专任教师和专业技术人员832人，教授级（含主任医师）21人，副教授级（含副主任医师等）118人，讲师级（含主治医师等）430人，此外还聘请了一批知名专家和教学医院主任工程师为兼职教授（其中博士生导师7名）。学院拥有浙江省高校中青年学科带头人、杭州市新世纪“131”优秀中青年人才等22人。承担国家级、省部级、市厅级科研项目26项，获得国家级、省部级、市厅级科研成果奖60项，发表论文1046篇，编写专著46部。
杭州师范大学医学院拥有一所三级乙等综合性附属医院（杭州市第二人民医院），450张床位，占地面积42000平方米，建筑面积38000平方米，拥有螺旋CT、彩超等先进医疗仪器设备，总值达2700万元。学院还有4所非直属附属医院、40余所教学医院和实习医院。教学医院总床位数达到13700张。
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